公司转让，也就是股权转让，涉及到所得税、印花税、契税等。如果转让方是个人，要交纳个人所得税，按照20%缴纳。如果转让方是公司，则需要涉及的税费较多，内资企业转让股权涉及的税种 公司将股权转让给某公司，该股权转让所得，将涉及到企业所得税、营业税、契税、印花税等。变更中可能会产生手续费和资料费等等
首先，应该缴纳的个人所得税，这一点是大家在办理股权转让事务室=时不能忽视的一个重点，个人股权转让应该缴纳的税额的计算，应该是个人转让股权的所得属于财产转让所得项目，以转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额为应纳税所得额，按20%税率缴纳个人所得税按次征收税款。
同时，如果股权转让成功以后，受让方没有及时按照规定的期限支付价款，那么受让方就需要支付一定的违约金，需要支付的金额是按照财产转让所得项目计算缴纳的个人所得税，税款由取得所得的转让方个人向主管税务机关自行申报缴纳。如果股权没有转让成功，取得的违约金收入不需缴纳个人所得税。
公司股权转让的一般程序是：股东向董事会提出转让申请，董事会提交股东大会讨论，经法定人数半数以上的股东同意后方可转让，签订股权转让协议，拟定公司章程修正案或新章程，到工商局进行注册变更。
注意事项：1、转让定价的公允性； 2、其他股东的收购优先权； 3、转让程序的合法性
公司股权转让的程序：
1、召开公司股东大会，研究股权出售和收购股权的可行性，分析出售和收购股权的目的是否符合公司的战略发展，并对收购方的经济实力经营能力进行分析，严格按照公司法的规定程序进行操作。
2、聘请律师进行律师尽职调查。
3、出让和受让双方进行实质性的协商和谈判。
4、出让方（国有、集体）企业向上级主管部门提出股权转让申请，并经上级主管部门批准。
5、评估、验资（私营有限公司也可以协商确定股权转让价格）。
6、出让的股权属于国有企业或国有独资有限公司的，需到国有资产办进行立项、确认，然后再到资产评估事务所进行评估。其他类型企业可直接到会计事务所对变更后的资本进行验资。
7、出让方召开职工大会或股东大会。集体企业性质的企业需召开职工大会或职工代表大会，按《工会法》条例形成职代会决议。有限公司性质的需召开股东（部分）大会，并形成股东大会决议，按照公司章程规定的程序和表决方法通过并形成书面的股东会决议。
8、股权变动的公司需召开股东大会，并形成决议。
9、出让方和受让方签定股权转让合同或股权转让协议。
10、由产权交易中心审理合同及附件，并办理交割手续（私营有限公司可不需要）。
11、到各有关部门办理变更、登记等手续。